除尘系统管道防腐是保证系统正常运行和使用寿命的重要措施，尤其是输送含有腐蚀性气体的管道系统。防腐的主要方法是采用防腐涂料和防腐材料。
(1)防腐涂料
防腐涂料由主要成膜物质(合成树脂、天然树脂、干性油与合成树脂改性油料)、辅助成膜物质(填料、稀释剂、固化剂、增塑剂、催干剂、改进剂等)和次要成膜物质(着色颜料、防锈颜料)三个部分组成。
涂料保护又可分为内防腐和外防腐两种。内防腐是为隔离内部腐蚀介质的腐蚀而在管道和设备的内壁用涂料；外防腐是在管道和设备外壁用涂料，以隔离大气中腐蚀介质的腐蚀，并起到装饰作用。使用目的不同，选用涂料的要求亦不相同。
(2)防腐材料
当管道系统输送腐蚀性较大的气体介质时，可以选用防腐材料加工管道和设备。常用的防腐材料有硬聚氯乙烯塑料、玻璃钢和其他复合衬里材料。
硬聚氯乙烯塑料(硬PVC)具有耐酸碱腐蚀性强、物理机械性能好、表面光滑、易于二次加工成型、施工维修方便等优点，但其使用温度要求在60℃以下，线膨胀系数大。
玻璃钢质轻、强度高、耐化学腐蚀性优良、电绝缘性好，耐温90～180℃，便于加工成型。但价格较贵，施工时有气味。
此外，还可选用不锈钢板、塑料复合钢板、玻璃钢/聚氯乙烯(FRP/PVC)等复合防腐材料。也可在管道和设备内衬橡胶衬里或铸石衬里。